肠企这两年|金唯智:16S玩出新花样,多招助力检测
热心肠小伙伴们 2021-07-12
三代测序如何助力微生物组研究?扩增偏好性如何解决?

■ 肠企简介

GENEWIZ(金唯智生物科技)成立于 1999 年,总部位于美国新泽西州,是专注于基因组研究和基因技术应用的生物科技公司。金唯智在全球范围内为科学研究人员提供高通量测序、基因编辑、Sanger 测序、基因合成、引物合成、分子生物学服务及 GLP 标准规范服务。

基于金唯智严谨的科学和卓越的服务,包括近 30 位诺贝尔奖获得者在内的众多科研工作者已成为金唯智的忠实客户,全球诸多知名跨国公司以及著名高等学府也把金唯智选为其战略合作伙伴和首选供应商。2018 年,金唯智正式加入 Brooks 集团,成为纳斯达克上市公司的一部分。

■ 这两年 | 3大事件

① 2019 年 11 月,金唯智开发新型技术测通腺相关病毒基因组(AAV)的反向末端重复序列(ITR)区域,解决基因治疗痛点。

② 2020 年疫情期间,金唯智助力抗击新冠,合成核酸检测的荧光检测探针和引物,新型冠状病毒“2019-nCoV”的关键基因。

③ 2021 年 1 月,金唯智中国总部实验大楼封顶建成,预计年内投入使用。

■ 这两年 | 微生物组创新

基于 PacBio 三代单分子实时测序平台推出了全长 16S 扩增测序服务及三代宏基因组测序服务:

① 全长 16S 扩增测序可应用于肠道菌群组成的鉴定,具有高准确性、无 GC bias 的特点。

② 三代宏基因组测序服务,不仅能检测肠道微生物的群落组成,还能研究菌群功能及其对宿主人体健康与疾病发生的影响。

③ 三代宏基因组测序无需组装就可以得到更为准确的功能基因序列,而通过组装甚至可以得到优势菌种的全基因组序列信息。

■ 肠道大会重磅亮相

① 基于二代测序的微生物相关测序产品,包括微生物多样性、宏基因组、宏转录组测序分析服务。

② 基于三代测序的基因组组学技术服务,包括全长 16S、基因组 de novo 测序及生物信息学分析服务。

■ 专访

问:金唯智针对微生物群落测序推出了 16S MetaVx™ 平台,能否为我们简单介绍一下该平台的优势与特点?目前是否有开展关于微生物组测序的相关研究,以进一步提升检测的准确性?

答:16SMetaVx™ 是金唯智自主研发并且申请专利的一套扩增体系。在文库扩增时,PCR 偏好性及其它因素会影响微生物物种的最终检测准确性,因此我们优化了扩增方案,将物种损失降到最低。通过 16S MetaVx™ 体系可以最大限度覆盖所有菌种,保证痕量微生物的检测。

在微生物测序方面,我们一直在不断的创新,以满足客户更多的需求。我们现在正在研发扩增试剂盒,客户可以直接交由我们扩增测序,这样可以大大提升检测速度,更加方便快捷。

问:作为成立了 20 多年之久的国际基因组服务公司,金唯智的业务范围广泛。那么,针对中国市场,未来会如何布局与肠道相关的业务呢?将会着力发力哪些方向?

答:肠道微生物和多种疾病息息相关,针对代谢类疾病的肠道研究也越来越多。对此,金唯智正着手布局一站式的解决方案,从菌种鉴定、菌群组成与多样性研究、基因表达与代谢调控分析和代谢功能等层面提供全面服务。

通过 16S 与宏基因组测序,对肠道菌群结构、菌群多样性、菌群丰度及功能进行研究,同时结合宏转录组测序获得基因表达量及差异表达基因信息,利用代谢组分析微生物的代谢功能,多角度分析肠道微生物群落间的相互作用及与宿主的相互作用,全面助力肠道微生物研究。

未来我们将和更多的医院及肠道研究科研工作者合作,为他们提供更快更好的服务。

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