陈卫华+赵兴明等：用于识别和校正宏基因组数据装配错误工具

陈卫华+赵兴明等：用于识别和校正宏基因组数据装配错误工具—metaMIC

热心肠小伙伴们 2022-11-24

近日，复旦大学类脑智能科学与技术研究院Luis Pedro Coelho、赵兴明、华中科技大学陈卫华及团队在Genome Biology发表最新研究，开发了一种基于机器学习，用于全自动识别和纠正宏基因组数据中装配错误的工具metaMIC（https://github.com/ZhaoXM-Lab/metaMIC），通过模拟和真实数据集验证，发现metaMIC的性能良好可为下游分箱提供可靠基础，值得测试。

构建可靠的宏基因组组装基因组（MAGs）对于理解微生物群落、分类注释和代谢过程重建具有重要意义，因此降低数据组装contigs错误率对于后续分析至关重要。近日，复旦大学类脑智能科学与技术研究院路易斯·佩德罗·科埃略（Luis Pedro Coelho）、赵兴明、华中科技大学陈卫华及团队在Genome Biology发表最新研究，开发了一种基于机器学习，用于全自动识别和纠正宏基因组数据中装配错误的工具metaMIC（https://github.com/ZhaoXM-Lab/metaMIC），通过模拟和真实数据集验证，发现metaMIC的性能良好可为下游分箱提供可靠基础，值得测试。

专家简介

陈卫华

华中科技大学生命科学与技术学院教授、博士生导师

陈卫华，教授、博士生导师；海外引进高层次人才。研究主要方向是肠道菌群精细调控与人体健康。通过实验与生物信息学分析相结合，发现肠道和肿瘤部位微生态异常与疾病的关联；利用噬菌体或小分子物质对特定肠道细菌精准调控，以达到改善微生态、改善和治疗疾病之目的。截止2021年9月，以主要作者（通讯或第一）身份在Science、Cell Metabolism、Nature Communications、Molecular Systems Biology、Nucleic Acids Research等杂志发表文章60多篇。他引4100多次，H-因子28。

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