医学博士，博士生导师，上海中医药大学交叉科学研究院研究员、特聘教授、上海市东方学者（特聘教授）、曙光学者与浦江人才计划获得者。目前主持国家重点研发计划子课题、国家自然科学基金面上项目等多个国家级与上海市人才项目，先后在Nature Reviews Drug Discover, Clinical Pharmacology and Therapeutics,Cell Death & Disease, Journal of Proteome Research,Science Translational Medicine, Diabetes等国际主流学术期刊发表SCI学术论文40余篇。

朱瑞新教授所领导的团队致力于生物信息驱动（数据驱动）的宏基因组相关研究，尤其擅长于宏基因组相关算法开发以及微生物与宿主或环境互作分析。 以第一或通讯作者身份(含并列)在包括Nature Ecology & Evolution, Nature Microbiology, The Lancet Gastroenterology & Hepatology，Cell Reports Medicine, Nature Communications 和 Gut等知名期刊发表SCI论文65篇。 主编出版了国内“计算机辅助药物设计”第一本本科生专业教材：《计算机辅助药物设计：基本方法原理概要与实践详解》（朱瑞新编著，大连理工大学出版社，2011年，ISBN 978-7-5611-6104-3）。 任期刊Frontiers in Pharmacology(IF=5.81)和Frontiers in Microbiology(IF=5.64)副主编。 已培养出2名独立PI。