戴磊等Nature子刊:新型成像技术助力解析微生物组空间结构
热心肠小伙伴们 2023-03-22
近日,中国科学院深圳先进技术研究院戴磊及团队在Nature Communications发表最新研究,开发了一种可容错编码的序贯荧光原位杂交技术,用于解析复杂微生物群落的空间结构。该方法可识别复杂群落中的不同微生物物种,在单细胞尺度上原位解析微生物物种间以及微生物-宿主间的互作。总之,该技术是研究微生物群落生态和功能的重要工具,值得关注。

自然界中各种微生物独特的生存方式和相互作用关系构成了群落特定的空间结构。尽管现有的高通量测序技术能够描绘微生物群落的物种组成及丰度,但仍缺乏解析群落空间结构的有力工具。近日,中国科学院深圳先进技术研究院戴磊及团队在Nature Communications发表最新研究Spatial profiling of microbial communities by sequential FISH with error-robust encoding,开发了一种可容错编码的序贯荧光原位杂交技术,用于解析复杂微生物群落的空间结构。该方法可识别复杂群落中的不同微生物物种,在单细胞尺度上原位解析微生物物种间以及微生物-宿主间的互作。总之,该技术是研究微生物群落生态和功能的重要工具,值得关注。

专家简介
戴磊
中国科学院深圳先进技术研究院研究员
中科院深圳先进技术研究院合成生物学研究所合成微生物组学中心主任
戴磊,中国科学院深圳先进技术研究院研究员,国家重点研发计划青年项目负责人,入选《麻省理工科技评论》中国区“35岁以下科技创新35人”。戴磊实验室致力于对宿主共生微生物群落的生态和功能进行精准表征和调控,解决人体健康、农业生产等重大问题。近五年研究成果以(共同)通讯作者发表在Cell Host & Microbe、Nature Communications、The ISME Journal、ACS Synthetic Biology、iMeta等学术期刊。
了解更多
相关推荐
戴磊+刘洋彧Nature子刊:机器学习模型预测外来细菌的定植结局
复杂群落的外来细菌定植结局取决于复杂的种间相互作用,其中很多暂未被揭示,中国科学院深圳先进技术研究院戴磊、哈佛大学医学院刘洋彧与团队发表研究,基于数据驱动预测外来细菌的定植结局。
2024-03-20
马迎飞+戴磊等Cell子刊:通过噬菌体培养组解析肠道暗物质
中科院先进院马迎飞、戴磊与团队在Cell Host and Microbe发表重要研究,首次建立了大规模肠道主要共生细菌噬菌体培养组技术,利用噬菌体培养物解析了肠道细菌和噬菌体长期共存的机制,并展示了这些噬菌体在肠道菌群调控中的应用潜力。本研究针对肠道主要共生细菌构建噬菌体资源库,展示了这些噬菌体培养物在肠道菌群调控中的价值。利用这一资源拟开展的肠道噬菌体和细菌的互作研究,有助于深入了解肠道菌群的多样性、功能和作用,为预防和治疗相关疾病提供新的思路和方法。
2023-04-15
戴磊团队:解析膳食纤维干预下肠道微生物组的生态应答
近日,中国科学院深圳先进技术研究院合成微生物组学研究中心戴磊团队在ISME Journal上发表最新研究,通过广义Lotka-Volterra(gLV)模型为框架,解析膳食纤维干预下肠道菌群应答的生态学机制,发现某些细菌在菊粉作用下显著增加,其基线丰度和种间竞争解释了微生物群落密度和组成动态的基线依赖性,并揭示了微生物生态网络对于理解与预测肠道菌群应答的重要性。总之,该研究为未来系统理解肠道菌群的生态学规律以及开发相应的精准营养调控手段奠定了重要基础。
2022-06-02
评论
热门分类