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Nadine Ziemert
文章数:2篇
次级代谢产物
Nature子刊:大规模分析细菌编码的次级代谢产物
Nature Microbiology发表的这项研究,采用两种算法对细菌基因组数据进行了大规模挖掘,全面分析了细菌中编码的次级代谢产物,揭示了各菌属之间生物合成多样性的巨大差异,并鉴定出多个有研究前景的细菌分类群。该研究的发现和提出的分析方法流程,对于从细菌中挖掘候选药物具有参考意义。
次级代谢产物
细菌基因组学
宏基因组学
靶向基因组挖掘
ARTS-DB:抗生素抗性靶标数据库
本文中作者展示了 抗生素抗性靶标搜寻器(ARTS) 数据库,这是一个综合性存储库,包含来自 NCBI 的 RefSeq 和 GEM 目录的高质量细菌基因组集,并使用靶向基因组挖掘(TDGM )策略进行处理。ARTS 数据库允许研究人员快速访问预先计算的 ARTS 结果并通过更广泛的视野探索细菌界。作者相信 ARTS 数据库将成为寻找新型天然产物的重要资源。ARTS 数据库可在 https://arts-db.ziemertlab.com/ 上在线公开访问,没有访问限制。
靶向基因组挖掘
ARTS 数据库
生物合成基因簇
宏基因组组装基因组
抗生素