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Jonathan L Golob
文章数:3篇
早产
Cell子刊:机器学习通过阴道微生物组特征进行早产预测
每年,11%的婴儿出现早产,对健康产生重大影响,而阴道微生物群落是早产的危险因素。Cell Reports Medicine近期发表的文章,利用机器学习开发出基于阴道微生物组来预测早产的模型,或可更好地了解和预防早产。
早产
阴道微生物组
机器学习
Cell子刊:基于系统型特征或可实现不同来源16S数据集的整合、分析和预测
这是发表于Cell Reports Methods上的一份工作,作者基于系统发育位置,将ASV 放入全长、非簇状 16S rRNA 等位基因的共同系统发育树上后,将其合并为系统发育相关的序列组,生成与分类无关的“系统型”count,以实现跨平台、跨16S靶向测序位置、独立于分类的16S扩增子特征。他们基于六项真实人群16S扩增子数据集进行了整合、分析和预测,以检验该方法的生物学意义和稳定性。(MaLiAmPi链接; https://github.com/jgolob/maliampi)
口腔菌群
早期牙周炎与克罗恩病的恶化相关
JCI insight上发表的一项前瞻性队列研究结果,对60名IBD患者及45名健康对照进行12个月随访,发现IBD患者的口腔菌群的肠道定殖显著增加,而早期牙周炎与克罗恩病患者的疾病活动指数增加相关。
口腔菌群
研究论文
前瞻性队列研究
克罗恩病
牙周炎