变分推理

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差异丰度分析

国内团队：用于菌群关联分析的R包-MZINBVA

上海交通大学王涛团队近期在Briefings in Bioinformatics发表文章，提出了用于菌群研究中关联分析的多级零膨胀负二项式模型，开发了一种用于最大似然估计和推理的变分逼近方法，其使用优化而不是抽样来近似对数似然和计算参数估计，提供参数估计协方差的稳健估计，并构建用于关联测试的 Wald 型检验统计量。作者开发了一个 R 包 MZINBVA 来实现所提出的方法，可从 GitHub 资源库 https://github.com/liudoubletian/MZINBVA 上获得。

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