Anthony A Fodor

虽然既往的研究认为女性阴道菌群或许与不良妊娠结局风险之间存在关联，但由于阴道菌群结构的影响因素众多，缺乏对阴道菌群影响因素的全面探索的文章。本研究通过对妊娠期阴道菌群结构的分析，发现种族、年龄、阴道盥洗等因素在其中的作用，并且也证实了阴道菌群与自发性早产的关联。提示未来在对阴道菌群研究时，应该注意采集其阴道盥洗习惯等信息。

阴道菌群研究论文孕妇阴道盥洗自发性早产

16S rRNA 基因测序

16S rRNA基因数据的变异识别软件HashSeq

本文中作者介绍了一种快速且可扩展的算法-HashSeq，该算法基于作为测序深度函数的正态分布背景误差的估计来推断序列变体。作者的流程具备有吸引力的性能特征，可以独立使用或与其他变体识别程序联合使用，并为每个变体提供明确的 P 值来评估变体是由测序错误引起的可能性。

16S rRNA 基因测序序列变异参考数据库正态分布

基于零膨胀分位数的方法

通过零膨胀分位数法 (ZINQ) 对微生物组数据进行非参数关联检验

本研究提出了 ZINQ，这是一种微生物群与二分或定量临床变量之间基于分位数的关联检验，基于一系列场景中的真实数据和对真实数据集的应用的全面模拟表明，与现有检验相比，即使它提供了更好的假阳性控制，ZINQ 通常具有相等或更高的功效，其为当前的菌群差异丰度分析提供了强大而可靠的替代方案。这项工作为菌群数据的关联检验提供了一种稳健而强大的非参数回归方法。

基于零膨胀分位数的方法 I类错误控制菌群差异丰度分析异质性

骨关节炎

肥胖相关骨关节炎的血清LPS水平升高

Arthritis and Rheumatology上发表的一项最新研究，发现肥胖相关骨关节炎（OA）患者的粪便菌群多样性及组成与对照无显著差异，而血浆骨调素及血清LPS水平显著升高。

骨关节炎肥胖研究论文队列研究 LPS

代谢手术

RYGB减肥手术后，肠道菌群有哪些特征性变化？

Roux-en-Y胃旁路术（RYGB）等减肥手术，可引起肠道菌群的显著变化，可能参与了减肥手术带来的健康效应。Gut Microbes近期发表的一项研究，揭示了在不同队列中一致存在的RYGB术后肠道菌群变化。

代谢手术减肥手术肠道菌群

神经性厌食症

神经性厌食症患者的肠道菌群或不影响体重？

神经性厌食症患者的肠道菌群组成发生改变。Gut Microbes上发表的一项最新研究，发现将神经性厌食症患者的粪菌移植给无菌小鼠后，相比于移植健康对照的粪菌，并未显著影响小鼠的体重、脂肪量及盲肠重量。

神经性厌食症基础研究研究论文啮齿动物（小鼠）

血压

肠道菌群及血浆代谢产物与血压的关联

Hypertension上发表的一项队列研究结果，对超过1000名中国成年人的肠道菌群、血浆代谢产物及血压进行分析，发现了菌群及特定代谢产物（如脂质）在收缩压及舒张压中的潜在调控作用。

血压研究论文队列研究血浆代谢产物

饮食

钠/钾摄入如何影响中国人的肠道菌群及血浆代谢物

在小鼠实验及小规模人体试验中，钠摄入可改变肠道菌群及宿主代谢产物。American Journal of Clinical Nutrition上发表的一项队列研究结果，对近3000名中国成年人的饮食钠/钾摄入进行评估，并分析肠道菌群及血浆代谢组，发现钠/钾摄入及钠/钾比值与特定分类群（包括一些致病菌及短链脂肪酸产生菌）及代谢产物相关，且表现出地域特征。

饮食 Diet population-based cohort Chinese Adult

限菌动物模型

定植人类粪菌的小鼠，其肠道菌群与人的相似度有多高？

将人体菌群移植给无菌小鼠，是研究菌群与疾病关系的重要试验手段。《ISME Journal》发表的一项最新研究，通过分析序列变异（sequence variant）数据，来确定哪些供体细菌成功植入到受体小鼠中。结果表明，受体小鼠的菌群仅能在一定程度上反映供体菌群的组成。这些发现再次提示人们，动物模型中得到的结论能否直接外推到人体，需要打个问号。

限菌动物模型 microbial ecology Microbiome 微生物生态学肠道菌群

结直肠癌

结肠粘膜生物膜、宿主和大肠癌的相互作用

宿主和肠道细菌之间的相互作用被破坏与结直肠癌（CRC）的发生有关。然而，这些细菌的活性及其与宿主之间的相互作用尚不清楚。此外，细菌如何组织/定位，以及它们所表达的基因，都可能对CRC发病机制具有同样重要的影响。近来，在约52%CRC患者和约13%健康人的上皮表面发现长达200微米的细菌生物被膜（BF）。此前已发现，在多个临床前小鼠模型中，来自CRC患者或健康人的BF形成细菌在CRC发展中起到功能性的角色，突出了细菌的组织形式对CRC产生的影响。最新发表在mSystems的研究发现在BF阳性菌群中，细菌毒力基因数量增加，并鉴定了一个保守的、可传播的BF阳性相关细菌核心组。此外，还证明了BF状态和CRC的发展改变了miRNA的表达，特异性miRNA与BF阳性相关类群相关。破译这种复杂的相互作用可能会发现CRC新的调节途径和具有潜在治疗意义的分子。

结直肠癌 biofilm colorectal cancer germfree microRNAs

结直肠癌

结肠粘膜生物被膜有致癌性

《Journal of Clinical Investigation》上发表的一项最新研究，发现无论是结直肠癌患者还是健康人，其结肠粘膜中的生物被膜在结直肠癌小鼠模型中均可诱导癌症的发生。这一研究进一步揭示了肠道菌群在促进结直肠癌发生发展中的重要作用，未来的研究或可鉴定出结肠粘膜生物被膜中促进结直肠癌发生发展的菌种或特定菌群组成，有助于结直肠癌的预防及早期干预。

结直肠癌 bacterial infections colorectal cancer Microbiology mouse models

胰腺导管腺癌(PDAC)

胰腺菌群和肠道菌群如何影响胰腺癌？

来自佛罗里达大学的一项研究，发现胰腺菌群无法用来区分胰腺癌和非胰腺癌，但肠道菌群可通过远距离方式影响胰腺肿瘤的生长，提示以肠道菌群为靶点或能用于防治胰腺癌。

胰腺导管腺癌(PDAC) 肠道菌群胰腺菌群异种移植物 Clea Bárcena

糖摄入

营养学杂志：幼年摄入不同单糖，影响菌群而不影响体重

幼年的时候吃进去的果糖和葡萄糖的比例不一样，会增加或降低肥胖风险么？这个研究的答案是：菌群变了，但不影响体重。有趣的研究，推荐给大家。

糖摄入菌群肥胖 Fei Wang Jingfeng Wang

结肠炎

Science：炎症毁菌，菌增炎症，终而癌也！

① 炎症反应改变结肠炎易感的IL-10敲除小鼠的肠道菌群组成；② 在AOM（致癌物偶氮甲烷）处理的IL-10敲除小鼠体内定植大肠杆菌NC101促进侵袭性癌的发生；③ 除炎症外，结肠炎相关结直肠癌的发生还需细菌特异性因子pks（聚酮合成酶），敲除NC101的pks导致肿瘤侵袭性降低，但不影响肠道炎症反应；④ 粘膜相关psk阳性大肠杆菌在炎症性肠炎及CRC中比例明显升高；⑤ 小鼠中，结肠炎通过改变微生物组成和诱导具有遗传毒性的微生物扩张来促进肿瘤的发生。

结肠炎结肠直肠癌聚酮合成酶 Francesco Strati Carlotta De Filippo