4月，最值得看的30篇肠道健康文献！

肠道细菌基因水平转移工业化 human gut microbiome Industrialization urbanization lifestyle horizontal gene transfer Bacterial genomics Host-microbe interactions culturomics Antimicrobial resistance virulence Mathieu Groussin Mathilde Poyet Eric J Alm

2 评论收藏

Science：让肠道菌群“返祖”一定有益健康吗？（观点）

Science [IF:63.714]

① 有假说认为让肠道菌群“返祖”有助于减少慢性疾病，但该观点存在一些问题；② 如：怎样确定祖先的菌群长啥样，祖先的菌群是否真的更有益健康，而且操纵菌群必须考虑个体化差异；③ 从进化的角度来看，工业化迫使菌群发生适应性变化，可能使得人-菌群-环境的三角关系建立了新的平衡状态，让菌群“返祖”可能会改变这一三角关系，从而带来新的健康风险；④ 修复人-菌群-环境之间的不匹配，需要的是精细调节，而不是简单粗暴的让菌群“返祖”。

Gut microbiota through an evolutionary lens

2021-04-30, doi:10.1126/science.abf0590

工业化肠道菌群进化 Rachel N Carmody Aspen T Reese

4 评论收藏

Science：用特殊饮食辅助药物抗癌（新闻）

Science [IF:63.714]

① 一些特殊饮食或能增强抗癌药物的疗效，饮食-药物的组合依肿瘤类型和基因突变而异；② 对于PI3K通路活化的子宫内膜癌，生酮饮食或能增强PI3K抑制剂的疗效；③ 化疗+模拟禁食饮食治疗乳腺癌，或能减少正常细胞损伤、增强癌细胞的药物敏感性；④ 一些癌症的生长高度依赖于特定氨基酸（如p53突变癌需要丝氨酸和甘氨酸），限制相应氨基酸的饮食或能增强放化疗的效果；⑤ 这类疗法已经/即将开展初步临床试验，但也面临患者对特殊饮食的依从性等问题。

A plateful of medicine

2021-04-02, doi:10.1126/science.372.6537.20

癌症治疗饮食 Jocelyn Kaiser

1 评论收藏

Science：一种新发现的杯状细胞，对肠道黏液屏障的形成至关重要

Science [IF:63.714]

① 小鼠肠道杯状细胞（GC）根据基因表达谱可分为多种亚群（结肠8种、小肠9种），GC分化成熟的轨迹可归为2条；② 结肠的隐窝间GC（icGC）与隐窝内GC分泌的黏液都能阻挡细菌大小的颗粒，但前者能允许小分子通过（可能利于营养吸收），后者则非常致密（保护干细胞巢），二者共同形成黏液屏障；③ icGC缺陷型小鼠的结肠黏液屏障完整性受损，对结肠炎更易感；④ 活检样本分析表明，溃结患者的GC脱落增多、icGC减少，伴随结肠黏液屏障缺陷。

An intercrypt subpopulation of goblet cells is essential for colonic mucus barrier function

2021-04-16, doi:10.1126/science.abb1590

延伸阅读：【Medical Xpress】【临床与基础研究】

肠道黏液层杯状细胞肠上皮结肠炎肠道屏障 Malin E V Johansson Elisabeth E L Nyström Beatriz Martinez-Abad

2 评论收藏

Nature：小肠T细胞如何耐受高浓度的胆汁酸？

Nature [IF:69.504]

① 小肠固有层的CD4+效应T细胞（Teff）中，核受体CAR（由Nrli3基因编码）调控异生物质转运体MDR1（促进胆汁酸解毒和抑制小肠炎症）的表达；② CAR影响小肠（而非结肠）固有层Teff的转录程序，上调胆汁酸解毒相关的酶和转运体的表达（类似其在肝细胞中的作用），并促进表达关键抗炎细胞因子IL-10；③ 在胆汁酸驱动的回肠炎小鼠模型中，CAR缺陷型Teff会加剧炎症，而用药物激活CAR有抗炎效果；④ 因此，小肠Teff中CAR促进解毒胆汁酸、减轻炎症。

CAR directs T cell adaptation to bile acids in the small intestine

2021-04-07, doi:10.1038/s41586-021-03421-6

延伸阅读：【肠道菌群与代谢】【Medical Xpress】

小肠炎症胆汁酸 CD4+效应T细胞黏膜免疫克罗恩病 Mark S Sundrud Mei Lan Chen Xiangsheng Huang David D Moore

4 评论收藏

Nature：艰难梭菌“剥削”宿主炎症反应中产生的代谢物

Nature [IF:69.504]

① 在小鼠肠道中定植野生型艰难梭菌（Cd）和不产毒素的突变型Cd，其中野生型Cd引发更严重的炎症，伴随Cd的山梨醇代谢途径上调；② Cd通过上调该途径来利用源自饮食和宿主产生的山梨醇作为养分，当山梨醇缺乏时，Cd的毒素表达升高；③ 宿主通过醛糖还原酶将葡萄糖转化为山梨醇，该酶在多种肠道免疫细胞中表达，且在Cd感染等引发的炎症期间表达上调，参与宿主抗感染免疫应答；④ Cd产生毒素引发宿主炎症，从而诱导宿主生成更多山梨醇来为Cd所用。

C. difficile exploits a host metabolite produced during toxin-mediated disease

2021-04-28, doi:10.1038/s41586-021-03502-6

延伸阅读：【肠道菌群与代谢】

宿主-致病菌互作艰难梭菌山梨醇 Justin L Sonnenburg Kali M Pruss

2 评论收藏

Nature：靶向gp130或可用于抗TNF治疗无效的克罗恩病

Nature [IF:69.504]

① 携带NOD2功能缺失突变的克罗恩病患者中，活化成纤维细胞及炎症巨噬细胞中的WT1及STAT3等上游转录因子富集，以上调NOD2缺陷相关的促炎及促纤维化因子；② 缺失NOD2的CD14+ PBMC可产生更多的胶原高表达细胞；③ 抗TNF治疗不应答患者的IL-11、OSM、IL-6等gp130家族基因表达升高；④ 在斑马鱼中，NOD2缺失导致相似的髓系细胞-基质细胞活化表型，gp130抑制剂缓解DSS诱导的肠道炎症，并降低白细胞浸润及WT1等的表达（在NOD2缺失个体中更为明显）。

A myeloid–stromal niche and gp130 rescue in NOD2-driven Crohn’s disease

2021-03-31, doi:10.1038/s41586-021-03484-5

延伸阅读：【Nature】【BioArt】【梅斯医学】【Medical Xpress】

克罗恩病研究论文 gp130 Nod2 单核细胞巨噬细胞成纤维细胞基础研究其它动物 stat3 WT1 抗TNF治疗 Judy H Cho Shikha Nayar

4 评论收藏

Nature Reviews：一文读懂肠道微环境中的芳香烃受体（综述）

Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology [IF:73.082]

① 稳态下，饮食或菌群来源的配体激活免疫细胞及其它细胞的AHR信号，通过分泌IL-22、诱导IL-10R表达、强化紧密连接功能等方式维持肠道屏障完整性；② AHR缺陷导致嗜酸性粒细胞及中性粒细胞增加、ILC3及IEL减少、IL-22缺失、促炎因子增加及肠道屏障受损；③ AHR在上皮细胞、内皮细胞以及肠神经系统的神经元中也有重要的功能，但研究较少；④ AHR可抑制结肠恶性肿瘤的发生发展；⑤ 需要新的模型和工具来分析体内细胞和组织类型特异性的AHR功能。

AHR in the intestinal microenvironment: safeguarding barrier function

2021-03-19, doi:10.1038/s41575-021-00430-8

芳香烃受体综述 Brigitta Stockinger

2 评论收藏

Nature Reviews：一文读懂肠神经胶质细胞（综述）

Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology [IF:73.082]

① 肠神经胶质细胞是一类异质性的外周神经胶质细胞群体，可调节肠神经系统稳态；② 肠神经胶质细胞和神经元之间的主动信号传导机制可调节肠道反射；③ 肠神经胶质细胞在特定情况下可驱动神经炎症，并通过与神经元和免疫细胞的互作促进神经可塑性、调节胃肠免疫稳态；④ 肠神经胶质细胞和癌症干细胞之间的互作调节肿瘤发生；⑤ 靶向神经胶质机制（如神经胶质递质释放、促进神经胶质增生的信号通路）的疗法，或有助于常见胃肠道疾病的治疗。

Enteric glial biology, intercellular signalling and roles in gastrointestinal disease

2021-03-17, doi:10.1038/s41575-021-00423-7

肠神经系统肠神经胶质 Brian D Gulbransen Luisa Seguella

1 评论收藏

Lancet子刊：胃肠道菌群与癌症（综述）

Lancet Gastroenterology & Hepatology [IF:45.042]

① 结直肠癌中特定细菌物种（具核梭杆菌等）富集，幽门螺杆菌定殖是胃癌的风险因素，胃肠道菌群特征也与某些胃肠道外癌症相关；② 血液中的菌群特征或可用于癌症诊断，肿瘤组织的菌群特征与结直肠癌、食管癌、胰腺导管腺癌的预后相关；③ 菌群可通过直接代谢药物、调节肿瘤细胞通路、增强药物毒性等方式影响化疗药物的疗效；④ 菌群还可影响免疫检查点抑制剂的疗效、增强肿瘤疫苗的作用、调节肿瘤免疫微环境；⑤ 调节菌群可能预防或帮助治疗癌症。

The relationship between gastrointestinal cancers and the microbiota

2021-03-17, doi:10.1016/S2468-1253(20)30362-9

Susan Bullman Kaitlyn D LaCourse

3 评论收藏

卜鹏程等Cell子刊突破：膳食补充剂肌酸如何促进癌症转移

Cell Metabolism [IF:31.373]

① 在原位肿瘤小鼠模型中，补充肌酸促进结直肠癌（CRC）和乳腺癌的转移，缩短生存期；② 甘氨酸脒基转移酶（GATM，肌酸合成的限速酶）在CRC和乳腺癌转移组织中高表达，且GATM表达越高，患者预后越差，高表达GATM促进CRC发生肝转移；③ 补充膳食肌酸，或由GATM介导的肌酸从头合成，能够通过单极纺锤体1激酶（MPS1，而非TGF-β受体）活化Smad2/3，上调肿瘤细胞中Snail和Snug的表达，从而促进CRC和乳腺癌的转移、缩短小鼠生存期；④ 敲低GATM、抑制GATM酶活或抑制MPS1活性，能够抑制小鼠肿瘤的转移。

Creatine promotes cancer metastasis through activation of Smad2/3

2021-04-02, doi:10.1016/j.cmet.2021.03.009

延伸阅读：【热心肠研究院】【BioArt】【生物在线】

肌酸癌症转移结直肠癌乳腺癌 creatine colorectal cancer Metastasis GATM MPS1 SMAD2 Smad3 breast cancer SLC6A8 Liwen Zhang Pengcheng Bu Gang Chen Hai-long Piao

1 评论收藏

Cell子刊：细菌易位促进大肠癌肝转移

Cancer Cell [IF:38.585]

① CRC患者CD31+内皮细胞中的PV-1+细胞比例高于健康人，且癌组织与癌旁组织的PV-1+细胞比例相似；② PV-1高表达与远端转移及更短的无进展生存期相关；③ 原发肿瘤中可检测到PV-1+细胞的患者的肝转移灶中有更多细菌，定殖于SOX9+高增殖癌细胞附近；④ CRC小鼠中，肝脏菌群与结肠菌群的相似度高于健康小鼠，且大肠杆菌富集；⑤ 大肠杆菌C17通过毒力调节因子VirF驱动小鼠GVB损伤，到达肝脏以促进PMN形成，而抗生素可抑制GVB损伤，以减少CRC的肝转移。

Gut vascular barrier impairment leads to intestinal bacteria dissemination and colorectal cancer metastasis to liver

2021-04-01, doi:10.1016/j.ccell.2021.03.004

延伸阅读：【DrGut】【BioArt】【生物谷】【奇点网】

肿瘤相关细菌结直肠癌肝转移研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）结直肠癌 PV-1 肠道血管屏障肠-肝轴 colorectal cancer metastases vasculature gut vascular barrier bacteria Escherichia Coli premetastatic niche neutrophils Macrophages inflammatory monocytes Maria Rescigno Alice Bertocchi

3 评论收藏

Cell子刊：抗大肠癌，一种细菌或有奇效？

Cell Host and Microbe [IF:31.316]

① 天然和适应性免疫信号分子TAK1在髓系细胞中的缺失使小鼠对DSS诱导的结肠炎和结肠癌具有抵抗力；② Tak1ΔM/ΔM小鼠菌群发生改变，可促进IL-1β和IL-6信号通路，从而诱导肠道保护性Th17细胞增加，并抵抗结肠炎和结肠癌；③ Tak1ΔM/ΔM小鼠菌群移植可对抗结肠炎或CRC；④ 内脏臭气杆菌在Tak1ΔM/ΔM小鼠中富集，可诱导肠道Th17细胞发育，并使野生型小鼠对结肠炎和CRC具有抗性。

Microbiota regulate innate immune signaling and protective immunity against cancer

2021-04-23, doi:10.1016/j.chom.2021.03.016

延伸阅读：【肠菌与健康】【DrGut】【中国生物技术网】【Cell Host and Microbe】【华大科技BGITech】

结直肠癌研究论文基础研究 TAK1信号急性结肠炎结肠癌菌群天然免疫 Th17细胞拟杆菌属内脏臭气杆菌 Rong-Fu Wang Changsheng Xing

3 评论收藏

Cell子刊：详解昼夜节律-共生菌群-代谢稳态互作网络（综述）

Cell Metabolism [IF:31.373]

① 宿主昼夜节律、营养和代谢信号与肠道微生物（GM）之间形成了复杂的互作调控网络，调节宿主体内代谢稳态；② 胃肠道生理的昼夜节律影响细菌获得营养物质的时间和效率，间接影响细菌代谢产物的节律性和生成；③ 表达模式具有昼夜节律的免疫反应标记物，可通过检测微生物代谢产物来感知GM，而GM的基因表达也会具有昼夜节律性；④ 与进食节律、光节律有关的生物钟系统的紊乱，可间接影响GM，成为慢性代谢性疾病发生与发展的潜在风险。

Circadian rhythms and the gut microbiome synchronize the host’s metabolic response to diet

2021-03-30, doi:10.1016/j.cmet.2021.03.015

延伸阅读：【临床与基础研究】

昼夜节律代谢稳态宿主-细菌互作综述饮食代谢免疫代谢疾病 Molly S Bray Diana E Gutierrez Lopez

1 评论收藏

杨朝勇+王炜：肠道菌群“暗物质”现形记（综述）

Accounts of Chemical Research [IF:24.466]

① 针对肠道共生菌和致病菌的可视化原位成像技术研究有助于揭示肠道菌群的“暗物质”；② 其中衍生化抗生素染色探针直接结合特定的细菌表面结构，可用于选择性标记不同种类的肠道细菌；③ 使用非天然氨基酸、糖和稳定同位素的基于代谢标记的成像策略，可在不同尺度和环境下对肠道细菌成像；④ 基于荧光核酸染料或DNA特异性探针等可视化策略可在结肠组织切片上绘制菌群图；⑤ 利用荧光蛋白或声学反应蛋白等基因工程技术修饰菌群也可用于菌群成像。

Imaging Commensal Microbiota and Pathogenic Bacteria in the Gut

2021-04-15, doi:10.1021/acs.accounts.1c00068

肠道菌群成像技术活体3D成像评述化学方法 Wei Wang Chaoyong Yang Liyuan Lin

2 评论收藏

任文凯团队：详解肠道真菌群与健康和疾病（综述）

Microbiome [IF:16.837]

① 肠道真菌的研究方法以培养和测序为主；② 对肠道真菌群的定殖和组成特征的研究仍处于起步阶段，分娩方式、膳食营养、环境和季节等因素可影响肠道真菌的组成；③ 肠道真菌群通过自身组分、直接代谢产物、提取物及次生代谢物与宿主免疫互作，可能对IBD、乳糜泻、肠癌和IBS等肠道疾病造成影响；④ 肠道真菌群还可通过肠肺轴、肠脑轴和肠肝轴，甚至肠肾轴和肠胰腺轴，影响远端组织疾病和生理功能；⑤ 肠道真菌可为各种疾病的诊断和治疗提供新机遇。

Intestinal mycobiota in health and diseases: from a disrupted equilibrium to clinical opportunities

2021-03-14, doi:10.1186/s40168-021-01024-x

肠道真菌组肠道免疫肠-X轴 Xiaoyan Wu Yaoyao Xia Congrui Zhu Wenkai Ren

1 评论收藏

华中农业大学：发展微生物组医学，如何进行因果推理？（综述）

Trends in Microbiology [IF:18.23]

① 用实验方法来推理菌群-疾病因果关系存在一定局限性，但可通过计算方法来建立；② 孟德尔随机化分析可有效揭示菌群群与疾病的直接因果关系，这种因果关系可通过干预主义框架进行评估；③ 中介分析和结构方程模型通过分析各种因素的中介作用，可以揭示菌群与疾病的直接和间接的因果关系；④ 研究菌群与疾病的因果关系和菌群相关基因变异，有助于实施个性化饮食干预；⑤ 了解饮食、菌群、宿主和疾病之间的因果关系对未来的微生物组医学至关重要。

Causal Inference in Microbiome Medicine: Principles and Applications

2021-04-21, doi:10.1016/j.tim.2021.03.015

因果推理 causal inference microbiome medicine Mendelian randomization analysis mediation analysis structural equation model dietary intervention 微生物组医学 Hongyu Zhang Bo-Min Lv

3 评论收藏

郑大一附院任志刚/余祖江+李兰娟院士：新冠如何影响口腔和肠道菌群及脂质组？

Gut [IF:31.793]

① 收集中国中部和东部的392份舌苔、172份粪便和155份血清样本；② 与健康对照（HC）相比，确诊病人（CP）的口腔和粪便微生物群的多样性显著降低，口腔中丁酸产生菌减少，脂多糖产生菌增多；③ 利用8种口腔菌群和7种粪便菌群对人群是否感染COVID-19进行诊断，效果良好，不同区域的人群中诊断效能高达87.24%，并且成功将IgG阳性的疑似病人诊断为CP，诊断效能达92.11%；④ 与CP相比，确诊并恢复的患者中有47个脂质分子减少，122个脂质分子富集。

Alterations in the human oral and gut microbiomes and lipidomics in COVID-19

2021-03-31, doi:10.1136/gutjnl-2020-323826

延伸阅读：【微生态】【iNature】

COVID-19 口腔微生物群肠道微生物群脂质组学 Zhigang Ren Zujiang Yu Lanjuan Li Haiyu Wang Guangying Cui Haifeng Lu

4 评论收藏

陈家亮、黄秀娟等：粪菌移植+生活方式干预，对肥胖+糖尿病患者效果如何？

Gut [IF:31.793]

① 61名2型糖尿病+肥胖患者随机分为3组：粪菌移植（FMT）+生活方式干预（LSI）、FMT、LSI，每4周干预一次至第12周，FMT溶液来自6名健康瘦供体；② FMT+LSI组、FMT组及LSI组患者达到主要终点（在第24周获得≥20%的瘦供体相关菌群）的比例分别为100%、88.2%和22%；③ 重复FMT显著增加了瘦供体相关菌群的定殖，FMT或FMT+LSI显著增加了丁酸盐产生菌；④ 与基线相比，FMT+LSI组在第24周时，总胆固醇、LDL胆固醇及肝脏硬度显著降低。