《自然·医学》发力！三文聚焦菌群与肿瘤免疫治疗

Nature子刊：丁酸梭菌可增强免疫检查点抑制剂对肾细胞癌的疗效

① 29名未经治疗的转移性肾细胞癌患者随机分组，在接受纳武单抗+伊匹单抗治疗的同时，其中19名患者每日口服CBM588；② 干预12周后，相比于对照组，CBM588组患者的肠道菌群中的双歧杆菌属丰度未显著增加，但CBM588组应答患者的双歧杆菌属丰度显著增加；③ 相比于对照组，CBM588组患者的无进展生存期显著延长（12.7个月 vs. 2.5个月），客观应答率非显著地升高（58% vs. 20%）；④ 两组之间的3级及4级不良事件发生率无显著差异（50% vs. 52%）。

Nivolumab plus ipilimumab with or without live bacterial supplementation in metastatic renal cell carcinoma: a randomized phase 1 trial

2022-02-28, doi:10.1038/s41591-022-01694-6

延伸阅读：【Nature Medicine】【生物谷】【Medical Xpress】

肿瘤免疫治疗伊匹单抗纳武单抗研究论文医学研究 1期临床试验 Sarah K Highlander Sumanta K Pal Nazli Dizman Luis Meza Paulo Bergerot

赞评论收藏

Nature子刊：肠道菌群可影响黑色素瘤患者对PD-1单抗治疗的应答

Nature Medicine [IF:87.241]

① 纳入94名接受PD-1单抗治疗的黑色素瘤患者；② 治疗前（而非治疗4个月后）的肠道菌群组成与治疗一年后的临床结局相关；③ 将新队列与已发表的4个队列的数据进行荟萃分析，放线菌门、毛螺菌科/瘤胃球菌科与较好的临床应答相关，而革兰氏阴性菌与炎症肠道基因特征、血液中性粒细胞/淋巴细胞比值升高及较差的临床应答相关；④ 毛螺菌科富集与较好的临床应答相关，链球菌属富集与较差的临床应答相关，而两者的富集均与免疫相关不良事件相关。

Intestinal microbiota signatures of clinical response and immune-related adverse events in melanoma patients treated with anti-PD-1

2022-02-28, doi:10.1038/s41591-022-01698-2

延伸阅读：【Nature Reviews Clinical Oncology】【学术经纬】【转化医学网】【BioArt】

肿瘤免疫治疗研究论文队列研究 PD-1单抗菌群-免疫互作黑色素瘤 Hassane M Zarour Giorgio Trinchieri Amiran K Dzutsev John A McCulloch Diwakar Davar Richard R Rodrigues

1 评论收藏

Nature子刊：肠道菌群与免疫检查点抑制剂的临床反应相关

Nature Medicine [IF:87.241]

① 纳入5个观察队列共165例晚期皮肤黑色素瘤患者，收集免疫检查点阻断治疗（ICI）开始前的粪便样本，进行宏基因组测序；② 将测序结果与之前发表的147个宏基因组样本进行整合，发现肠道微生物组与ICI的响应相关，呈现队列相关性；③ 机器学习分析证实微生物组与ICI的总体应答率和无进展生存率之间的联系，同时也揭示了基于微生物组的特征在不同队列中的重复性有限；④ 鉴定出一组与ICI应答相关的物种，但没有一个物种可作为通用的生物标记物。

Cross-cohort gut microbiome associations with immune checkpoint inhibitor response in advanced melanoma

2022-02-28, doi:10.1038/s41591-022-01695-5

延伸阅读：【Nature Reviews Clinical Oncology】【ScienceDaily】

晚期黑色素瘤肠道菌群人群队列数据 Tim D Spector Rinse K Weersma Nicola Segata Karla A Lee Andrew Maltez Thomas Laura A Bolte

赞评论收藏

FMT或可治疗犊牛腹泻

Microbiome [IF:16.837]

① 健康供体犊牛粪便经直肠转移到20例受体腹泻犊牛体内，成功率为70%；② Selenomonasz同时存在于供体和受体粪便，FMT治疗成功的犊牛体内，Selenomonasz为优势菌；③ FMT治疗成功的犊牛中，微生物组和代谢组数据之间存在显著的正相关；④ Veillonellaceae科和代谢组特征（如氨基酸和短链脂肪酸）之间的正/负相关性有利于FMT疗效；⑤ Sporobacter或是FMT供体选择的潜在标志物，供/受体较低的3-磷酸甘油、磷酸二羟丙酮和异戊胺水平，或利于FMT治疗。

Development of a rational framework for the therapeutic efficacy of fecal microbiota transplantation for calf diarrhea treatment

2022-02-21, doi:10.1186/s40168-021-01217-4

FMT 犊牛腹泻肠道菌群代谢物 Jahidul Islam Hidekazu Tanaka Tomonori Nochi

1 评论收藏

陈鹏+姜勇团队：菌群代谢产物3-DHPPPA或可减轻肝脏缺血再灌注损伤

Acta Pharmaceutica Sinica B [IF:14.903]

① HIRI日变化:小鼠肝脏缺血再灌注损伤（HIRI）手术在晚上实施（ZT12）比在早上实施（ZT0）时更严重；② HIRI日变化与肠道菌群有关，在ZT0时，肠道微生物产生并积累3,4-二羟基苯基丙酸（3,4-DHPPA）；③ 3,4-DHPPA对小鼠肝脏缺血再灌注损伤（HIRI）具有显著的保护作用，可抑制巨噬细胞的促炎症反应，减少HIRI日变化；④ 3-DHPPPA抑制巨噬细胞促炎症反应，是通过降低组蛋白脱乙酰酶（HDAC）磷酸化水平抑制HDAC活性实现。

The gut microbial metabolite, 3,4- dihydroxyphenylpropionic acid, alleviates hepatic ischemia/reperfusion injury via mitigation of macrophage pro-inflammatory activity in mice

2021-06-01, doi:10.1016/j.apsb.2021.05.029

菌群代谢物肝脏缺血再灌注损伤巨噬细胞 3 4-Dihydroxyphenylpropionic acid Diurnal variation Gut microbiota Hepatic ischemia/reperfusion injury Rui Li Li Xie Lei Li Xiaojiao Chen Yong Jiang Peng Chen

赞评论收藏

公共人菌群数据库需要更多的发展中国家数据

PLoS Biology [IF:9.593]

① 从全球最大的3个基因组数据库中，分析444,829份人菌群样本的国家来源；② 这些样本来自于2,592项研究，覆盖了19个身体部位，接近一半（220,017份）为肠道菌群；③ 超过71%的样本来自欧洲、美国及加拿大，其中美国样本占了46.8%，而美国人口仅占全球的4.3%；④ 中亚及南亚是最未被充分代表的地区，印度、巴基斯坦、孟加拉国等国家占全球人口超过1/4，但仅有1.8%的样本来自这些国家。

Public human microbiome data are dominated by highly developed countries

2022-02-15, doi:10.1371/journal.pbio.3001536

延伸阅读：【Nature Reviews Microbiology】【Science】

菌群数据库研究论文基础研究 Richard J Abdill Ran Blekhman

1 评论收藏

Nature子刊：挖掘非洲人群的肠道菌群

Nature Communications [IF:17.694]

① 用短读长和长读长测序分析南非城市（51人）和农村（118人）的成年女性粪便；② 两个人群的微生物组成、多样性、功能性特征均有明显差异，且其微生物组成介于高收入国家和传统社区之间；③ 目前的参考基因组集合不能完整描述生活在高收入国家以外的个体的微生物组，会造成人为的低β多样性；④ 结合短/长读长测序和宏基因组组装，生成了多个未描述的分类群（如Treponema、Lentisphaerae和Succinatimonas）的完整基因组。

Short- and long-read metagenomics of urban and rural South African gut microbiomes reveal a transitional composition and undescribed taxa

2022-02-22, doi:10.1038/s41467-021-27917-x

延伸阅读：【Medical Xpress】

非洲人肠道菌群 Fiona B Tamburini Scott Hazelhurst Ami S Bhatt

1 评论收藏

核心菌群定义和量化的挑战与前景

PNAS [IF:12.779]

① 作者简要综述介绍了核心菌群概念的历史，并使用具有代表性的文献样本来回顾通常用于量化核心菌群的不同指标；② 实证分析使用了广泛的指标来量化核心菌群，包括任意出现和丰度阈值，核心菌群的从门到扩增子序列变体范围的核心物种分类水平；③ 然而，这些指标中的许多都容易受到抽样和其他偏差的影响；④ 最后作者指出对于开发一套标准化的指标来量化解释这种偏差的核心菌群对于测试关于核心菌群的功能和生态作用的特定假设是必要的。

Defining and quantifying the core microbiome: Challenges and prospects

2021-12-03, doi:10.1073/pnas.2104429118

核心菌群微生物分类群扩增子序列变异 (ASV) 宏分析生态作用 Alexander T Neu Kaustuv Roy

赞评论收藏

国内团队：警惕食源性二氧化钛纳米颗粒的肠道毒性

Science of the Total Environment [IF:10.753]

① 食源性二氧化钛（TiO2）破坏幼鼠肠道菌群稳态，拟杆菌属、双歧杆菌属、乳酸杆菌属和普雷沃氏菌属丰度显著改变；② TiO2也引发幼鼠黏膜通透性增加，肠屏障和免疫受损，炎症反应被激活，脂多糖水平升高；③ 其也降低抗菌肽、occludin和ZO-1的表达，增加JNK2和Src/pSrc表达，与微米级相比，纳米级TiO2毒性更强；④ 粪便菌群移植证实肠道菌群在毒性中发挥关键作用，焦谷氨酸、l -谷氨酸、苯乙酸和3-羟基苯乙酸等代谢产物可能是TiO2毒性标志物。

Intestinal toxicity of micro- and nano-particles of foodborne titanium dioxide in juvenile mice: Disorders of gut microbiota-host co-metabolites and intestinal barrier damage

2022-01-21, doi:10.1016/j.scitotenv.2022.153279

食源性二氧化钛（TiO2）颗粒 Jun Yan Xiaohua Liu Zhuge Xi

赞评论收藏

查看前一期内容（2022年03月01日） | 进入列表筛选 | 查看后一期内容（2022年03月03日）

往期日报更多>>

2月，最值得看的30篇肠道健康文献！

2022年2月，根据“热心肠因子”计算的30篇必读文献。

2022-03-01

大肠癌发病年轻化，Lancet子刊双综述讲透

本期话题：早发性大肠癌，风险评分，抗生素，环状RNA，IgG1，化疗，促炎饮食，生酮饮食

2022-02-28

重磅综述集结：膳食营养如何调控免疫与健康

本期话题：营养与免疫，植物肉，心血管，生物活性肽，维生素E，素食，姜，鸡蛋，n-3 PUFA

2022-02-27

9文聚焦皮肤菌群：为啥重要？受何调控？

本期话题：皮肤菌群，表皮葡萄球菌，皮肤屏障，毛囊，喹啉酸，菌群-免疫互作，耳念珠菌，痤疮丙酸杆菌，宿主因素，方法学

2022-02-26

今日Science：感染赋予肠道更强免疫力？新机制揭晓

本期话题：肠道免疫，ILC3，菌群调控，酶，噬菌体，普通拟杆菌，衰老，长双歧杆菌，蜜蜂，杀虫，斑马鱼

2022-02-25

今日Nature：肺部菌群影响大脑+肠菌毒素唤醒噬菌体

本期话题：肺部菌群，细菌间互作，益生菌，精神分裂症，肠脑轴，群体感应，抗生素，耐药菌，婴儿菌群

2022-02-24

间歇性禁食如何用于减肥？《自然·综述》一图读懂

本期话题：间歇性禁食，减肥，代谢健康，抗生素抗性组，饮食模式，肠道激素，脂代谢，饮食-菌群互作，饮食质量

2022-02-23

肠屏障“失守”：与啥有关/促啥疾病/如何改善？19页综述详解

本期话题：肠道屏障，肠道真菌，IBD，丁酸代谢菌，RA，IL-22，IL-18，自身免疫疾病，中性粒细胞，ILC3，褪黑素

2022-02-22

促肠癌菌如何让癌细胞变身“癌干细胞”？卜鹏程等详解机制

本期话题：大肠癌，癌干细胞，具核梭杆菌，胃癌，癌症筛查，前列腺癌，IL-37，肿瘤相关中性粒细胞，鱼，放化疗

2022-02-21

少吃蛋白质有益代谢健康？27分Cell子刊发出最新证据

本期话题：膳食蛋白质，盐摄入，碳水化合物，糖尿病，寿命，PUFA，大肠癌，心血管，加工肉，老年人

2022-02-20