第2705期：高分Nature子刊：新冠过度炎症与肠道真菌有何关系？
本期话题：新冠，真菌，类器官，肠脑轴，益生菌，IBD，组织修复，黏液层，菌群-免疫互作，精准医疗，心血管
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11月07日

Nature子刊：肠道白色念珠菌或导致重症新冠患者的持续性免疫激活

Nature Immunology [IF:30.5]
① 重症COVID-19（sCOVID-19）患者体内出现白色念珠菌（C.ab）等真菌抗体，肠道念珠菌过度生长及肠道真菌失调与sCOVID-19严重程度有关；② 肠道C.ab增加与中性粒细胞和钙卫蛋白水平升高有关，导致粒细胞祖细胞（GMP）转录特征改变和体内抗真菌免疫途径持续激活；③ C.ab定植小鼠感染新冠病毒后，肺部中性粒细胞及其胞外陷阱显著增加，抗真菌治疗或阻断IL-6受体可部分扭转；④ 托珠单抗可降低sCOVID-19患者C.ab抗体滴度、改善GMP转录特征。
【主编推荐语】多种涉及全身免疫激活的疾病与胃肠道真菌生态失调有关。重症新冠肺炎（sCOVID-19）患者也存在肠道菌群的改变，但这种改变是否持续性影响宿主免疫状况还不清楚。近日，Nature Immunology发表研究文章，发现sCOVID-19患者体内存在高滴度的白色念珠菌（Candida albicans，C.ab）抗体，而肠道C.ab通过升高血液和肺部中性粒细胞、持续改变粒细胞祖细胞转录特征而诱发持续的抗真菌免疫激活。作者还发现靶向IL-6受体的托珠单抗能够降低sCOVID19患者的C.ab 抗体，这种针对肠道真菌病原体的治疗策略或有助于控制sCOVID-19等炎症性疾病活跃期间的免疫过度激活。（@芥末）
Fungal microbiota sustains lasting immune activation of neutrophils and their progenitors in severe COVID-19
2023-10-23, doi:10.1038/s41590-023-01637-4
延伸阅读： 【Nature Immunology】 【Nature】 【Medical Xpress】
新冠 研究论文 肠道真菌 白色念珠菌 中性粒细胞 Iliyan D Iliev Takato Kusakabe
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Nature子刊：建立肠道类器官模型，研究新冠感染抗病毒反应

Nature Communications [IF:16.6]
① 建立新冠（SARS-CoV-2）感染的牙买加果蝠（ JFB）肠道类器官模型，以研究JFB肠上皮对新冠感染的抗病毒反应；② JFB类器官感染新冠后，病毒RNA和亚基因组RNA增加但无感染性病毒释放，表明JFB类器官仅支持有限的病毒复制但不支持病毒繁殖；③ 新冠复制与I型干扰素和炎症细胞因子基因表达显著增加相关；④ 新冠感染导致JFB类器官的形成和生长增强；⑤ 新冠感染导致JFB类器官中炎症信号传导、细胞更新、细胞修复和新冠感染途径增加。
【主编推荐语】蝙蝠是多种人畜共患病毒的天然宿主，然而其抗病毒反应机制尚不清楚。近日，发表在Nature Communications上的这篇文章，利用牙买加果蝠（JFB）肠道类器官模型研究新冠感染抗病毒反应，发现原代JFB肠上皮细胞可成功产生抗病毒干扰素反应，且新冠感染可诱导JFB细胞中保护性再生途径。（@圆圈儿）
Antiviral responses in a Jamaican fruit bat intestinal organoid model of SARS-CoV-2 infection
2023-10-28, doi:10.1038/s41467-023-42610-x
Diane Bimczok Marziah Hashimi
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Cell：新冠病毒持续存在和血清素减少，可导致长新冠症状？

Cell [IF:64.5]
① 评估了多项临床研究和动物模型血液和粪便样本中长期新冠的影响，发现残留病毒会影响干扰素水平，减少胃肠道对色氨酸的吸收；② 相比康复者，长新冠患者循环中的血清素降低，血清素水平与患者症状严重程度负相关；③ 色氨酸吸收减少会引起血清素耗尽，导致迷走神经信号中断，进而产生多种长新冠症状（如记忆力减退、疲劳）；④ 在动物模型中，通过使用5-羟色胺前体或选择性5-羟色胺再摄取抑制剂治疗，能够恢复血清素水平，从而逆转记忆障碍。
【主编推荐语】Covid-19急性期后遗症，也称为长新冠，是一个重大的全球健康挑战，其病理生理机制尚不清楚，目前尚没有有效的治疗方法。近日，宾夕法尼亚大学研究人员在Cell发表最新研究，系统揭示了新冠感染后出现的持续炎症导致长期神经症状的机制，指出病毒性炎症通过影响色氨酸吸收、降低血小板存储和增加血清素代谢酶的方式导致血清素缺乏。外周血清素减少会抑制迷走神经活性，导致海马体功能障碍和记忆损害。总之，本研究为针对预防和治疗长新冠神经认知症状提供了可能的靶点，值得关注。（@九卿臣）
Serotonin reduction in post-acute sequelae of viral infection
2023-10-16, doi:10.1016/j.cell.2023.09.013
延伸阅读： 【生物世界】 【生物谷】 【immunity速读】 【Bioon细胞】
长新冠 血清素 研究论文 基础研究 迷走神经 干扰素 色氨酸 记忆障碍 动物实验 临床研究 COVID‐19 Andrea C Wong Benjamin A Abramoff Sara Cherry Christoph A Thaiss Maayan Levy
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益生菌对COVID-19患者死亡率的影响

Inflammopharmacology [IF:5.8]
① 对多个数据库进行检索，纳入截至2023年4月4日所有使用益生菌作为干预措施及其对新冠患者全因死亡率影响的报道；② 纳入6项研究，共642例患者，评估益生菌在降低新冠患者全因死亡率方面的有效性；③ 采用随机效应模型的荟萃分析，与未服用益生菌的患者相比，补充益生菌的新冠患者全因死亡率显著降低（合并优势比0.44）；④ 虽然现有数据表明益生菌可提高新冠患者生存期，但仍需大规模随机试验数据以明确益生菌在降低新冠患者死亡率中的益处。
【主编推荐语】Inflammopharmacology近期发表的文章，通过系统综述和荟萃分析，发现在新冠肺炎患者中，使用益生菌对生存有益。但需要大规模随机试验的数据来明确证实益生菌在新冠肺炎患者群体中的死亡率益处。（@章台柳）
The effect of probiotics on the risk of mortality in patients with COVID-19: systematic review and meta-analysis of randomized trials
2023-10-17, doi:10.1007/s10787-023-01358-y
新冠肺炎 全因死亡率 益生菌 Chia Siang Kow
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Science子刊：克罗恩病遗传突变如何损伤肠上皮伤口愈合？

Science Translational Medicine [IF:17.1]
① 克罗恩病相关的肝细胞生长因子激活剂（HGFAC）R509H变异体，损伤连接凝血级联与生长因子的损伤感知途径；② HGFAC变异体激活时无法完全激活巨噬细胞刺激蛋白（MSP），导致伤口相关上皮（WAE）细胞诱导受损并延迟肠上皮伤口愈合；③ WAE细胞诱导受损后产生局部视黄酸梯度，以协调粘膜成纤维细胞反应并促进伤口愈合；④ 体外类器官共培养模型进一步阐明WAE细胞-成纤维细胞信号传导回路促进肠上皮愈合作用。
【主编推荐语】伤口相关上皮细胞（WAE）对于上皮细胞伤口愈合至关重要，但这些细胞如何协调愈合尚不清楚。近日，发表在Science Translational Medicine上的这篇文章，以单细胞分辨率绘制细胞间通讯图并与空间转录组学整合以剖析肠粘膜的愈合反应，揭示肠上皮愈合机制并表明MSP补充剂或可作为克罗恩病的潜在干预措施。（@圆圈儿）
Genetic vulnerability to Crohn’s disease reveals a spatially resolved epithelial restitution program
2023-10-25, doi:10.1126/scitranslmed.adg5252
Toru Nakata Daniel B Graham Ramnik J Xavier
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工业化的人类肠道微生物群可能促进肠道炎症

Gut Microbes [IF:12.2]
① 与泰国农村人的微生物群定植相比，美国人的微生物群定植于无菌小鼠导致小鼠小肠固有层和上皮内腔室中先天样CD8+T细胞的积累增加；② TCRγδ和CD8αα T细胞在接受西方微生物群的小鼠中都显示出显著的增加，同时这种表型也与肠道粘液厚度的增加有关；③ 偶然的是，一组意外感染的小鼠证实了炎症反应升高和肠道粘液厚度增加之间的联系；④ 这些结果表明，西方相关的人类肠道微生物可引起促炎免疫反应。
【主编推荐语】移民到一个高度工业化的国家与代谢性疾病和微生物群组成的同步变化有关，但其潜在机制在人体研究中具有挑战性。近期发表于Gut Microbes的一项初步研究，评估了从美国（典型的低膳食纤维的西式饮食）和泰国农村收集的人类肠道微生物群对小鼠肠道黏膜和免疫系统的不同影响。研究结果表明，西化的人类肠道微生物群可能在促进肠道炎症中发挥作用。（@注册营养师陈彬林）
Industrialized human gut microbiota increases CD8+ T cells and mucus thickness in humanized mouse gut
2023-10-18, doi:10.1080/19490976.2023.2266627
Dan Knights Pajau Vangay
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Cell子刊：KLF2+ CD4 T细胞可防止菌群诱导的肠炎

Cell Reports [IF:8.8]
① 肠道共生菌刺激会导致次级淋巴器官和肠道组织中共生特异性的KLF2+ CD4细胞积累扩大，且与FOXP3+ Treg细胞或其他分化谱系不同；② T细胞条件性KLF2缺陷小鼠会出现自发性直肠脱垂和肠炎，清除菌群或供体KLF2+ 细胞重建可恢复表型；③ 激活的KLF2+ CD4细胞通过产生IL-10发挥免疫调节作用，从而 发挥体外抑制功能和体内肠炎保护作用；④ 克罗恩病发炎组织中KLF2+ CD4细胞积累减少。
【主编推荐语】抗原性外来微生物肠道定植需要扩大外周免疫耐受性。近日，发表在Cell Reports上的这篇文章，研究了Kruppel样因子2（KLF2）转录调节因子调控的CD4 T细胞的共生菌群初始扩增，及KLF2+ CD4细胞在保护菌群驱动的肠炎中的重要作用。（@圆圈儿）
Kruppel-like factor 2+ CD4 T cells avert microbiota-induced intestinal inflammation
2023-10-26, doi:10.1016/j.celrep.2023.113323
Tzu-Yu Shao Sing Sing Way
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两种食品加工真菌或可预防肠炎

mSystems [IF:6.4]
① 研究食品生产中的五种酵母菌株（产朊假丝酵母Cj、汉逊德巴利酵母、单孢哈萨克斯坦酵母、乳酸克鲁维酵母Kl及膜醭毕赤酵母）预防肠炎的潜力；② Cj和Kl降低小鼠对结肠炎的敏感性；③ Cj而非Kl在肠道中转运；④ Cj无法粘附上皮细胞，且在肠道中存活时间小于24-48小时；⑤ Cj对免疫系统的影响中，IL-8通过Mif和Fkbp5发挥作用；⑥ Cj处理小鼠导致其细菌和真菌菌群均变化，益生菌增加而致病菌减少。
【主编推荐语】许多菌株因其发酵、产生风味或异源分子的能力而被用于食品工业，目前对食源性酵母多样性及其对肠道菌群和肠道健康的潜在影响知之甚少。近日，发表在mSystems上的这篇文章，发现产朊假丝酵母和乳酸克鲁维酵母菌株均具有作为益生菌酵母菌株对抗肠炎的潜力。（@圆圈儿）
Cyberlindnera jadinii and Kluyveromyces lactis, two fungi used in food processes, have potential probiotic effects on gut inflammation
2023-10-26, doi:10.1128/msystems.00841-23
延伸阅读： 【Medical Xpress】
Cindy Hugot Maxime Poirier Mathias L Richard
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Nature Reviews：mIBD精准医疗报告标准（综述）

Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology [IF:65.1]
① 基因学研究通过确定分子病因使单基因炎症性肠病(mIBD)患者可能获得基因型引导的精准医疗；② mIBD的治疗研究主要来源于回顾性观察性临床报告，缺乏前瞻性临床试验的疗效数据，多种治疗方法没有统一的结果报告标准，无法作为临床决策基础；③ mIBD患者的治疗目标应反映患者与健康相关的生活质量和疾病特异性预后，传统IBD治疗目标也适用于mIBD患者；④ mIBD报告标准应包括遗传学、表型、肠道炎症、肠外疾病、治疗和不良事件等分子诊断参数。
【主编推荐语】炎症性肠病通常认为为多因素导致。但随着基因组学研究的不断深入，现在已经有研究认为单个基因缺失与IBD有着密切关系，这种由于单个基因变异而引起的IBD称之为mIBD。mIBD由于其病因为单基因变异引起，因此可以进行针对性较强的靶向精准治疗，且临床上已经有各种不同的靶向精准治疗应用于mIBD的治疗。但是，目前对于mIBD的精准治疗尚缺乏统一的标准或者明确的专家共识。近期一篇发表在Nature子刊，Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上的专家建议，回顾了近年来mIBD的精准治疗临床实践，提出了关于mIBD精准治疗的拟议标准。（@Zhonghua）
Precision medicine in monogenic inflammatory bowel disease: proposed mIBD REPORT standards
2023-10-03, doi:10.1038/s41575-023-00838-4
mIBD 精准医疗 报告标准 综述 医学研究 单基因炎症性肠病 Holm H Uhlig
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IBD患者的心律失常风险增加

PLoS Medicine [IF:15.8]
① 纳入瑞典1969-2017年间的24,954名克罗恩病（CD）患者、46,856名溃疡性结肠炎（UC）患者及12,067名未分类IBD（IBD-U）患者；② 中位随访约10年期间，7.6%的CD患者、8.9%的UC患者及8.2%的IBD-U患者出现心律失常；③ 相比于参考个体（年龄、性别、国家、教育水平等相匹配）及无IBD的兄弟姐妹，CD患者、UC患者及IBD-U患者的心律失常风险分别增加15%、14%及30%；④ IBD患者的心律失常风险增加可持续至确诊后25年。
【主编推荐语】PLoS Medicine上发表的一项队列研究结果，在瑞典的超过8万名IBD患者中，相比于无IBD的兄弟姐妹及相匹配的对照，克罗恩病患者、溃疡性结肠炎患者及未分类IBD患者的心律失常风险均显著增加，且可持续至确诊后25年。（@aluba）
Long-term risk of arrhythmias in patients with inflammatory bowel disease: A population-based, sibling-controlled cohort study
2023-10-19, doi:10.1371/journal.pmed.1004305
延伸阅读： 【Medical Xpress】
IBD 心律失常 研究论文 队列研究 Jiangwei Sun
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