傅静远等Cell子刊：深度解码菌群基因结构变异与胆汁酸代谢

傅静远等Cell子刊：从微生物遗传组成的维度，解析人肠道菌群与胆汁酸代谢的关系

① 分析2个荷兰队列1437名受试者的肠道微生物宏基因组和血浆胆汁酸（BA）谱；② 发现肠道菌群的遗传组成（结构变异SV）与BA水平相关且独立于细菌丰度；③ 29种微生物的群体遗传结构呈现聚簇分层，其中13种与BA水平相关；④ 鉴定到809个SV和BA之间的可重复关联，并评估了相关的谱系效应影响；⑤ 在BA相关的SV区域内或邻近区域鉴定到BA合成转化相关基因，并用结构生物信息学验证；⑥ 推断得到217组生活方式→SV→BA的调控关系，包括鱼肉、苏打饮料摄入等。

Characterization of gut microbial structural variations as determinants of human bile acid metabolism

2021-11-29, doi:10.1016/j.chom.2021.11.003

微生物结构变异胆汁酸代谢研究论文 human gut microbiome bile acid metabolism Bacterial genetics structural variation population-based cohort study metagenome 肠道菌群 Jingyuan Fu Daoming Wang

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肠道菌群或可预测IBS患者对低FODMAP饮食的应答

Gut [IF:31.793]

① 纳入56名IBS患者，进行4周的低FODMAP饮食干预；② 患者干预前的粪便菌群表现为“类致病性”和“类健康”两种亚型，“类致病性”菌群的特征为：厚壁菌门增加、拟杆菌门减少、氨基酸和碳水化合物代谢基因富集；③ 干预后，携带“类致病性”菌群的患者的粪便菌群更趋近于健康对照，包括拟杆菌门增加、厚壁菌门减少、代谢基因恢复正常；④ 相比于携带“类健康”菌群的患者，携带“类致病性”菌群的患者对低FODMAP饮食的临床应答率更高。

Two microbiota subtypes identified in irritable bowel syndrome with distinct responses to the low FODMAP diet

2021-11-22, doi:10.1136/gutjnl-2021-325177

延伸阅读：【Medical Xpress】【Gut】

低FODMAP饮食 IBS 研究论文基础研究饮食-菌群互作队列研究预后标志物 Trevor D Lawley Miles Parkes Kevin Vervier Stephen Moss

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GLP-1/GLP-2受体双激动剂或可靶向肠肝轴和菌群，治疗脂肪肝炎

Hepatology [IF:17.298]

① 采用NASH损伤小鼠模型，皮下注射GLP1/2-Fc可降低体重、血糖、血脂，改善葡萄糖稳态和胰岛素敏感性；② GLP1/2-Fc可减少肝脏TG聚集和炎症，减少肝纤维化和细胞死亡；③ GLP1/2-Fc通过促进肠上皮再生、增强紧密连接、减少肠通透性以改善肠道功能环境，体外试验也发现类似作用；④ GLP1/2-Fc调节肠道菌群，Prevotella、Alistipes、乳酸菌等增加；⑤ FMT可提升GLP1-Fc组的治疗效果，包括体重变化、肝脏重量、肝脂积累、炎症和肝纤维化等。

A GLP-1/GLP-2 receptor dual agonist to treat non-alcoholic steatohepatitis: targeting the gut-liver axis and microbiome

2021-11-12, doi:10.1002/hep.32235

NAFLD/NASH GLP-1/GLP-2受体双激动剂肝-肠轴肠道菌群 Soo Han Bae Yong-ho Lee Eun Ran Kim Jeong Su Park

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Nature子刊：肠道病原菌“互帮互助”共度营养不良难关

Nature Communications [IF:17.694]

① 在营养不良下，来自人体的致病性肠杆菌科和拟杆菌属相互合作协同生长；② 当蛋白质或有机铁丰富时，协同生长是有限的；③ 而在蛋白质和铁缺乏的营养不良条件下，拟杆菌释放膳食和粘蛋白来源的糖，肠杆菌科提高铁的生物利用度，有利于它们相互依赖生长；④ 营养不良儿童中拟杆菌科和肠杆菌科有很强的相关性，而营养充足的儿童却没有，这与人类肠道中饮食依赖的生长协同作用相一致；⑤ 营养不良条件下，肠道中交互共生促进了病原体的过度生长。

Cross-feeding between intestinal pathobionts promotes their overgrowth during undernutrition

2021-11-25, doi:10.1038/s41467-021-27191-x

延伸阅读：【生物医学科研之家】

营养不良肠道病原菌交互共生 K E Huus T T Hoang B B Finlay

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Nature子刊：肠道菌群影响单核细胞增多性李斯特菌的定殖

Nature Communications [IF:17.694]

① 相比于李斯特菌属的非致病菌种，Lm有更高的宿主相关性；② Lm的粪便携带在人体中很常见，10%的健康人及20.8%的腹泻患者的粪便中可检测到Lm；③ Lm的粪便携带与特定的菌群特征（更高的毛螺菌科、红蝽菌目、放线菌科丰度等）及较低的菌群α多样性相关；④ Lm在小鼠体内的定殖与较低的肠道菌群α-多样性及肠道菌群组成相关；⑤ Lm定殖对小鼠肠道菌群的影响较小，而肠道菌群组成影响了Lm的定殖，抗生素处理可促进Lm在小鼠体内的定殖。

Listeria monocytogenes faecal carriage is common and depends on the gut microbiota

2021-11-24, doi:10.1038/s41467-021-27069-y

单核细胞增多性李斯特菌研究论文基础研究啮齿动物（小鼠） Lukas Hafner Maxime Pichon Marc Garcia-Garcera Marc Lecuit

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病原菌效应因子与宿主吞噬蛋白互作，决定宿主先天免疫反应

Gut Microbes [IF:9.434]

① 敲低宿主细胞ELMO1降低沙门氏菌内吞和宿主炎症因子水平；② ELMO1互作的IpgB1属于WxxxE特征序列家族蛋白，该家族蛋白仅存在于肠病原菌中，但不存在于肠共生菌中；③ SifA是沙门氏菌中含WxxxE特征序列的效应因子，与ELMO1直接互作；④ 敲除ELMO1或者SifA消除二者互作，显著影响细菌感染，降低宿主感染表型和免疫反应，其机制可能是ELMO1-SifA互作促进与DOCK180互作，进而影响Rac1活性；⑤ 细胞中过表达WxxxE家族效应蛋白显著促进细胞炎症水平。

The interaction of enteric bacterial effectors with the host engulfment pathway control innate immune responses

2021-11-01, doi:10.1080/19490976.2021.1991776

病原菌 WxxxE家族效应蛋白 ELMO1 SifA 炎症水平研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）细胞系实验 ELMO1敲除鼠 SifA敲除沙门氏菌巨噬细胞动物细胞细菌感染 Soumita Das Ibrahim M Sayed

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具核梭杆菌调节Th17反应，驱动促炎肠道微环境

Gut Microbes [IF:9.434]

① 给新生APC突变小鼠接种并定植具核梭杆菌菌株Fn7-1，在肿瘤形成之前驱动结肠中Il17a的表达，增强肠道肿瘤的发生；② 在菌群复杂度较低的小鼠中，肠道Fn7-1的定植会增加结肠Th17细胞以及IL-17A和IL-17F的表达，同时增加结肠固有层Il23p19的表达；③ 具核梭杆菌能产生大量的短链脂肪酸（SCFA），缺乏其受体FFAR2，Fn7-1的定植不能改变RORγt+CD4+t细胞比例；④ 肿瘤菌——产肠毒素脆弱拟杆菌也具有增加肠道Th17的潜力。

Fusobacterium nucleatum drives a pro-inflammatory intestinal microenvironment through metabolite receptor-dependent modulation of IL-17 expression

2021-11-15, doi:10.1080/19490976.2021.1987780

结直肠癌 Fusobacterium nucleatum Microbiome Th17 cells altered Schaedler’s flora colorectal cancer gnotobiotics interleukin 17 具核梭杆菌 IL-17 Wendy S Garrett Caitlin A Brennan

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肠道菌群失调与脑动脉瘤破裂有关

Stroke [IF:10.17]

① 一项多中心前瞻性病例对照研究纳入28例破裂动脉瘤（RAs）和33例未破裂颅内动脉瘤（UIAs），分析比较两组的菌群差异；② 两组患者的基础特征包括年龄、性别、高血压、血脂异常、糖尿病状况、体重指数和吸烟无差异；③ 两组患者的肠道菌群alpha多样性无差异，但beta多样性差异显著，在门水平上，RA组弯曲杆菌的相对丰度显著大于UIA组；④ 聚合酶链反应发现，RA组的弯曲杆菌属和解脲弯曲杆菌属的丰度显著较高。

Dysbiosis of Gut Microbiome Is Associated With Rupture of Cerebral Aneurysms

2021-11-03, doi:10.1161/STROKEAHA.121.034792

延伸阅读：【梅斯医学】

Shuhei Kawabata Masatoshi Takagaki

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北京协和医院：适度饮酒如何影响冠状动脉疾病患者的菌群及代谢

Frontiers in Cardiovascular Medicine [IF:5.846]

① 纳入72名不同饮酒量的冠状动脉疾病（CAD）男性患者和17名健康对照，对血清代谢组和粪便菌群进行对比分析；② 与非饮酒患者及重度饮酒患者相比，适度饮酒患者的鞘脂和甘油磷脂减少；③ 适度饮酒患者的肠道菌群代谢产物减少，其菌群结构与健康对照相似；④ 与非饮酒患者相比，适度饮酒患者的帕拉普氏菌属、赖氨酸芽孢杆菌属增加，双歧杆菌属、巨球型菌属和链球菌属减少；⑤ 多组学分析显示，适度饮酒患者的特定代谢产物和菌群与CAD严重程度相关。