Nature子刊:大规模测序发现新的克罗恩病关联基因和突变

Nature Genetics [IF:30.8]
① 分析来自3万多名克罗恩病(CD)患者和8万名对照人群序列数据,为更全面定义CD患者生物靶点;② 通过与编码变异关联,鉴定出10个一般发病型CD基因,4个位于已建立的CD GWAS基因座内;③ 在九个例子中,单个编码变体显著相关,而在第十个例子中,发现罕见的编码变异(ATG4C)在CD患者中显著增加;④ 发现多个新CD基因在不同信号通路(自噬,炎症反应功能等)中发挥重要作用,且一些基因突出了间充质细胞在肠道炎症发展和维持中的新兴作用。
【主编推荐语】克罗恩病(CD)是一种非特异性的肠道炎症性疾病,主要发病于末段回肠和右半结肠,由环境、免疫和细菌等因素在遗传易感个体上的组合所引起。目前,该病确切的免疫问题尚不明确。近日,研究人员在Nature Genetics发表最新研究,分析了来自3万多名克罗恩病(CD)患者和8万名对照人群序列数据,以期完善先前的GWASs研究结果,并更好地定义CD的生物靶点,发现10个与普通型CD发病相关的基因,还发现多个新CD基因在不同信号通路(自噬,炎症反应功能等)中发挥重要作用,并指出CD和间充质细胞间的关联,为新药研发以及CD治疗提供了新的理论基础,值得关注。(@九卿臣)
Large-scale sequencing identifies multiple genes and rare variants associated with Crohn’s disease susceptibility
2022-08-29, doi:10.1038/s41588-022-01156-2
延伸阅读: 【Medical Xpress】

治疗结肠炎的潜在噬菌体疗法

Journal of Crohn's and Colitis [IF:8]
① 使用含七种裂解性噬菌体混合物(EcoActive)处理210 种临床黏附侵袭性大肠杆菌(AIEC) 和 43 种健康人类微生物组常见属的非大肠杆菌菌株;② EcoActive对95%AIEC菌株有效,且不裂解43种非大肠杆菌菌株;③ 长期接受EcoActive疗法不会导致健康小鼠肠道菌群失调;④ 感染AIEC菌株LF82SK的结肠炎小鼠接受长期EcoActive疗法后,炎症症状显著改善,且未发现LF82SK易位。⑤ 结肠炎小鼠接受EcoActive疗法后,粪便LF82SK丰度降低,或与炎症改善有关。
【主编推荐语】在细菌耐药性日益严重的今天,噬菌体作为一种天然的治疗性制剂逐渐受到重视。克罗恩病患者的肠粘膜中黏附侵袭性大肠杆菌(AIEC)存在的比例较高,可能与炎症性肠病(IBD)的发病及加重相关。因此,特异性靶向人类肠道中的AIEC的噬菌体疗法或可用于缓解或治疗IBD。发表在Journal of Crohn's and Colitis上的一项研究显示,混合噬菌体疗法对于感染AIEC的结肠炎小鼠具有积极作用,或可用于克罗恩病的防治。(@EADGBE)
Safety and Efficacy of an AIEC-targeted Bacteriophage Cocktail in a Mice Colitis Model
2022-08-23, doi:10.1093/ecco-jcc/jjac064

郑浩+杨云生等:炎症性肠病相关细菌可引起蜜蜂认知障碍

Frontiers in cellular and infection microbiology [IF:5.7]
① 探究口服炎症性肠病相关大肠杆菌LF82和非致病性菌株MG1655对蜜蜂的影响;② LF82显著降低蜜蜂寿命,并诱导类肠炎症状,如肠透性增加、回肠上皮绒毛缺失及肠腔体积增大;③ LF82引起蜜蜂肠道中代谢物的广泛变化,下调参与精氨酸合成、嘧啶和色氨酸代谢的代谢物,包括犬尿氨酸和褪黑素;④ LF82可损害蜜蜂的学习和记忆能力;⑤ MG1655和LF82引起蜜蜂大脑中不同的转录组变化,LF82上调包括NF-kB p100和caspase-1在内的炎症相关信号通路。
【主编推荐语】早在2020年6月,发表在Gut杂志上的一项纵向研究[Gut, 2021, 70(1): 85-91]表明,包括溃疡性结肠炎和克罗恩病在内的炎症性肠病(IBD)使患者认知障碍风险增加一倍以上。但其机制尚不清楚。鉴于越来越多的证据表明肠道菌群与大脑疾病有关,在肠道细菌病原体感染后观察动物认知的研究在某些情况下可以提供更为准确的参考。来自中国农业大学的郑浩和中国人民解放军总医院杨云生等人发表在Frontiers in Cellular and Infection Microbiology上的一项研究探究了IBD相关大肠杆菌LF82对蜜蜂肠道代谢、脑转录组和认知的影响,一定程度上加深了对IBD相关细菌引起认知障碍的机制的理解。(@EADGBE)
Inflammatory bowel disease-associated Escherichia coli strain LF82 in the damage of gut and cognition of honeybees
2022-08-25, doi:10.3389/fcimb.2022.983169
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