巨噬细胞如何参与结肠炎相关肠道肿瘤的起始

Gastroenterology [IF:33.883]
① 在化学诱导和基因修饰的结肠炎相关癌症小鼠模型中,仅DSS诱导(而非TNBS、恶唑酮、鼠柠檬酸杆菌及阿霉素诱导)的结肠炎可导致癌症;② 与其他结肠炎模型相比,DSS使得炎症结肠中CD11b+ F4/80+ Ly6Chigh巨噬细胞和CD11b+ Ly6G+中性粒细胞显著增加,但仅缺失CD11b+ F4/80+ Ly6Chigh巨噬细胞可抑制肿瘤发生;③ DSS诱导时,肠道中促炎因子IL-1β、TNF-α和IL-6显著增加,将静止的Dclk1+细胞恢复到活跃分裂的干细胞状态,导致结肠肿瘤。
【主编推荐语】肠道的慢性炎症是结直肠癌(CRC)的重要危险因素,实验和临床证据都表明炎症性肠病与(CRC)风险增加有关。但是炎症导致CRC的机制尚不清楚,且研究中常用的肠道炎症模型小鼠间的炎症机制也存在差异。加拿大西安大略大学研究人员近日在Gastroenterology发表文章,对比了几种常见的结肠炎小鼠模型,发现仅葡聚糖硫酸钠盐(DSS)诱导的结肠炎会导致癌症,并进一步阐明了CD11b+ F4/80+ Ly6Chigh巨噬细胞及其分泌的促炎细胞因子是启动结肠炎相关结肠癌的关键介质。本研究揭示了巨噬细胞在结肠炎相关肠道肿瘤的起始中发挥的作用,为开发针对这些细胞的结肠炎相关癌症新疗法提供了新的视角。(@芥末)
F4/80+Ly6Chigh macrophages lead to cell plasticity and cancer initiation in colitis
2023-01-09, doi:10.1053/j.gastro.2023.01.002

Science子刊:深度蛋白组学区分转移与非转移性结直肠癌细胞间蛋白水平差异

Science Advances [IF:14.957]
① 使用四种基于CZE-MS/MS的策略对同基因非转移和转移性结直肠癌(CRC)细胞系进行了自下而上的蛋白组学(TDP)研究,共获得23622种蛋白质的2332种形式;② 已报道的CRC相关途径中的蛋白质形式可能参与驱动CRC进展和转移;③ 重要的肿瘤相关基因磷酸化(PTM)可能在调节CRC转移中发挥重要作用;④ 两种细胞系在单氨基酸变异(SAAV)谱方面也存在实质性差异;⑤ 定量TDP揭示了两种细胞系间差异表达的蛋白型,相应的基因功能多样,与癌症密切相关。
【主编推荐语】这是发表在Science Advances上的一份工作。作者通过使用不同的组学策略对于两种同基因的人结直肠癌细胞系进行了蛋白组学研究,以探究蛋白质水平与转移和非转移性之间的关系。作者通过深度自下而上的蛋白组学(TDP)研究,从两个细胞系中鉴定了23622种蛋白质的2332种蛋白质形式,相较之前的人类TDP数据集扩大了5倍。同时,作者也揭示了SW480和SW620细胞系在蛋白质形态和单氨基酸变异(SAAV)谱方面的实质性差异。定量TDP揭示了两种细胞系间差异表达的蛋白型,相应的基因功能多样,与癌症密切相关。当然,这项研究仍存部分限制,比如CZE-MS/MS 的上样能力较低,对于小型蛋白质(30 kDa以下)表征较好,同时使用常见的碰撞破碎技术制样会导致蛋白质形式的大量碎片化,无法准确定位PTM。(@Johnson)
Deep top-down proteomics revealed significant proteoform-level differences between metastatic and nonmetastatic colorectal cancer cells
2022-12-21, doi:10.1126/sciadv.abq6348
延伸阅读: 【Medical Xpress】

国内团队:FMT或可通过调控肿瘤免疫治疗CRC?

Pharmacological Research [IF:10.334]
① 对CRC(结直肠癌)患者的大规模多组学数据(微生物组、代谢组、转录组和单细胞RNA测序等)进行分析,发现CRC的菌群组成与健康对照不同,其菌群组成改变并与免疫细胞的特征基因如CXCR6等具有显著相关性;② 利用机器学习模型鉴定出28种CRC生物标记物,具有较高的准确性和临床适用性;③ 代谢物是CRC肠道菌群与肿瘤免疫状态之间的重要互作介质,移植自CRC患者的肠道菌群抑制了CRC的免疫疗效;④ 移植健康的肠道菌群或促进CRC的免疫疗效。
【主编推荐语】大量研究表明肠道菌群的变化与CRC有关,但宿主和肠道菌群之间的互作在很大程度上仍不清楚,较少有研究使用综合多组学数据来研究这些互作。国内团队近期发表在Pharmacological Research上的研究采用先进的生物信息学方法,对CRC患者的微生物组、代谢组、转录组和利用单细胞RNA测序等大规模多序列的数据集进行单独和整合分析,发现CRC患者相比健康对照具有显著不同的微生物群组成,且与患者的特征基因具有显著相关性,进一步发现特定的代谢物可以调控肿瘤免疫过程。这项研究解释了肠道菌群与CRC患者的免疫细胞浸润以及多种代谢途径改变密切相关,因此通过移植健康人的肠道菌群或可成为治疗CRC的新策略。(@MD)
Untangling Determinants of gut microbiota and tumor immunologic status through a multi-omics approach in colorectal cancer
2022-12-24, doi:10.1016/j.phrs.2022.106633

Nature:结肠镜筛查肠癌有效性的新争议(新闻评论)

Nature [IF:69.504]
① 结肠镜检查本可早期筛查癌症挽救生命,但欧洲的研究表明它并不如简单的方法如只检查部分结肠那么有效;② 这些研究的地点、方式、随访时间、研究本身及研究背景都会影响结肠镜检查结果;③ 由于侵入性和费用昂贵,结肠镜检查在欧洲并不像在美国那样普遍,但目前仍有几项大型研究支持结肠镜筛查癌症的有效性;④ CT 结肠造影、软式乙状结肠镜和粪便检查也可有效筛查癌症,研究人员正在完善关于癌症早期筛查检测方式的指导方针。
【主编推荐语】早期发现癌症可以挽救病人的生命,结直肠癌中,在转移前和转移后发现并治疗的病人其5年生存率分别约为91%和15%。然而,如何实现结直肠癌简单而有效早期筛查是个难题。近期发表在Nature上的News & Views讨论了结肠镜在美国和欧洲的使用情况、筛查有效性差异以及影响检测结果的因素,并鼓励具有更低侵入性和花费的检测方法如CT 结肠造影、软式乙状结肠镜和粪便检查等方式推出,并与结肠镜检测结合从而改善结直肠癌的早期筛查情况。(@MD)
Colonoscopies save lives. Why did a trial suggest they might not?
2023-01-10, doi:10.1038/d41586-023-00020-5

Nature子刊:用癌症早期的基因组突变进行肠癌早筛

Nature Communications [IF:17.694]
① 纳入144名IBD引起的CAC(结肠炎相关癌症)患者,定义其临床特征并绘制了IBD相关发育不良和癌症的基因突变谱,确定了基因组突变后高全局甲基化效应;② CAC患者在癌症早期发生高度TP53突变和很高的拷贝数变化频率;③ CAC患者中Wnt信号降低,基因转录重排,远离Wnt信号传导和谱系可塑性,表明肿瘤不再依赖于Wnt 信号生长;④ 来自小鼠模型和患者的多个异型增生/癌症病变的测序分析结果表明早期癌症的基因突变是独立事件。
【主编推荐语】炎症促进癌症发生,如炎症性肠病患者患肠癌的风险会增加,目前认为基因变化可能是这种现象的基础。近期发表在Nature Communications上的一项研究利用结肠炎相关癌症患者的样本分析了其临床特征和基因组特征等改变,发现TP53改变是结肠炎相关癌症的早期和高发事件,而Wnt通路的改变并不常见。并利用小鼠模型和患者的多个不典型增生病变部位进行测序也得到一致结论。该发现表明,炎症背景下发生的肿瘤性病变在肿瘤发生的早期经历了与Wnt激活无关的谱系突变,识别这些突变或可为肿瘤的早期检测提供新方法。(@MD)
Integrated clinical and genomic analysis identifies driver events and molecular evolution of colitis-associated cancers
2023-01-07, doi:10.1038/s41467-022-35592-9
清淡更健康?吃得太辣太刺激如何影响肠道?
本期话题:刺激物,辣椒素,饮食与遗传,饮食模式,营养素摄入,脂肪酸,乳制品,麦麸,有害物质
2023-01-15
多文聚焦IBS最新研究:针灸治疗有效吗?
本期话题:肠易激综合征,多组学,虚弱,针灸,腹痛,肠神经,妊娠糖尿病,FMT,SLE
2023-01-14
今日Science:肠道菌群如何影响神经退行性疾病?
本期话题:肠脑轴,神经退行性疾病,多发性硬化,帕金森病,肥胖,神经,有害物质,肠-脑互作失调
2023-01-13
《自然·综述》年度回顾:助力研究微生物组疗法的新工具
本期话题:方法工具,Akk菌,FMT,脂肪肝,胆汁酸,铁,化学介质,药物-组学关联,细菌基因传递,动物肠道菌群
2023-01-12
病从口入:口腔菌群和口腔疾病如何影响全身健康?
本期话题:口腔菌群,口腔疾病,心血管,1型糖尿病,牙膏,生命早期,肥胖,多发性硬化,口臭,古人
2023-01-11
肠-肺轴新发现:“坏”菌定植肠道如何恶化肺部感染?
本期话题:肠肺轴,感染,细菌疫苗,霍乱弧菌,幽门螺杆菌,TH17,T细胞,工程菌,药物递送,IBD,天然产物
2023-01-10
GUT新发现:肠菌可影响大肠癌术后的吻合口愈合
本期话题:术后愈合,超加工食品,有机食品,上皮TGFβ,诊断模型,免疫治疗,液体活检,超声技术,肝内胆管癌,胃肠道恶性肿瘤
2023-01-09
31分Cell子刊3文聚焦饮食:精准营养/限时进食/肠道菌群
本期话题:精准营养,1型糖尿病,限时进食,减肥,癫痫,甲硫氨酸限制,衰老,低蛋白饮食,膳食碳水,生活方式
2023-01-08
多文速览:消化道医疗器械和生物材料的技术创新
本期话题:医疗器械,生物传感器,消化内镜,显微成像,胰腺炎,AI,环保,胃功能障碍,生物材料,类器官
2023-01-07
张和平团队Nature子刊突破:高分辨率解析内蒙人的肠道菌群
本期话题:宏基因组组装基因组,关节炎,伤口菌群,生信,肠-肌肉轴,衰老,抗生素耐药基因,寄生虫
2023-01-06